6月份，新疆大部分棉区天气较好，日间温度维持在25-35度，利于棉花快速生长。月底棉株开花数量明显增加，目前棉株高度多已达到60-70公分。
由于今年整体播种期后延，叠加种植阶段天气不利等因素，且重播棉花长势明显偏慢，预计今年新疆大部分地区打顶时间集中于7月10日前后，较往年推迟一周。对于棉农来讲，棉花打顶一向坚持“枝到不等时，时到不等枝”。因此，6月中旬以来，众多种植户就已经加强了田间管理，尽量弥补前期的生长差距。
今年北疆部分地区棉花在种植期主要受到突降雨雪、低温等灾害性天气，导致刚播种不久出土棉苗被冻伤、冻死，棉农被迫重播或者补种。北疆前期受灾地区主要集中于奎屯、沙湾、哈密等地，博乐、乌苏影响相对较小，但得益于5月下旬后气温快速回升，以及种植户及时打药防治蚜虫、棉铃虫和红蜘蛛等病虫害，同时加强补充水肥促进棉花营养生长和生殖生长，目前重播棉花果枝多在5-7台，与未受灾棉花仅差1-2台果枝。
今年，南疆阿克苏地区、喀什地区多地在种植期因多次遭遇持续大降雨、沙尘暴，导致棉田土壤板结、棉苗折断等侵袭，一些地区进行了多次重播，因此整体生长进度偏慢。
多地棉农表示，今年打顶工作只能按实际情况做灵活调整，不会盲目采用“枝到不等时，时到不等枝“的规则。对于未受灾棉花会按正常进度进行打顶，但对于明显偏慢棉株则继续以加强水肥管理促进生长至打顶标准。而延后打顶的棉花会在最后采收脱叶时再次适当放宽时间，来保证质量与产量目标。
